JCIM | 片段热点映射以识别相关蛋白间的选择性决定域
背景介绍 基于片段的药物发现(FBDD)已经成为一个用来识别探针分子和先导化合物的强大工具。过去20年里,FBDD发现了4种已批准的药物,数十种…… Continue reading
背景介绍 基于片段的药物发现(FBDD)已经成为一个用来识别探针分子和先导化合物的强大工具。过去20年里,FBDD发现了4种已批准的药物,数十种…… Continue reading
Polyply包含了:1)一种多尺度图匹配算法,用于快速生成参数,并适用于任意复杂的聚合物拓扑;2)通用的多尺度随机行走协议,能够高效地建立复杂…… Continue reading
通过高通量虚拟筛选发现了MCULE-5948770040,一种作用于SARS-CoV-2主要蛋白酶的新型非共价小分子抑制剂。进一步的湿实验、X射…… Continue reading
通过QM/MM分子动力学模拟和同位素标记实验,作者发现在倍半萜SdS合成酶中去质子化-再质子化序列可以通过G1/2 helix这段保守结构域的主…… Continue reading
SARS-CoV-2的突变体是如何影响RBD-ACE2复合物的形成的呢?原子力显微镜和分子动力学模拟揭示了关于SARS-CoV-2突变体结合的原…… Continue reading
通过实验结合计算的方法,证明了四环素衍生物对FP-2的变构抑制作用,预测了可能的结合模式,为进一步优化四环素骨架及发现选择性更好效力更强的抑制剂…… Continue reading
一种基于注意力的卷积神经网络深度学习模型,该模型可利用初级序列生成的简单二级结构来提供高度准确的糖基转移酶折叠预测。 背景介绍 糖基转移酶(GT…… Continue reading
使用氢-氘交换质谱(HDX-MS)结合计算建模,提供了一种新颖的方法来可视化降解诱导的三元复合物,体现了理性降解剂设计的思想,是第一个利用溶液数…… Continue reading
华中科技大学宁康教授团队基于地球上4个主要生物群落(肠道、湖泊、土壤和发酵罐)的42.5亿个微生物群落序列构建了AI模型MetaSource,预…… Continue reading
一种基于几何结构软件和深度学习的新框架DeepPoc一套挖掘苗头片段周围的化学空间的流程,它可以找到结合模式相似且新颖的类似物。在对BRD4案例…… Continue reading