Nat. Commun. | 利用可解释深度学习绘制糖基转移酶折叠图景
一种基于注意力的卷积神经网络深度学习模型,该模型可利用初级序列生成的简单二级结构来提供高度准确的糖基转移酶折叠预测。 背景介绍 糖基转移酶(GT…… Continue reading
一种基于注意力的卷积神经网络深度学习模型,该模型可利用初级序列生成的简单二级结构来提供高度准确的糖基转移酶折叠预测。 背景介绍 糖基转移酶(GT…… Continue reading
华中科技大学宁康教授团队基于地球上4个主要生物群落(肠道、湖泊、土壤和发酵罐)的42.5亿个微生物群落序列构建了AI模型MetaSource,预…… Continue reading
一种通用且可配置的深度学习框架,可利用3D卷积神经网络进行蛋白质-蛋白质界面(PPIs)的数据挖掘。 背景介绍 高度调控的蛋白-蛋白相互作用网络…… Continue reading
中科院上药所郑明月研究员团队利用深度生成模型、激酶选择性筛选等计算手段,设计了一种新型DDR1抑制剂,该化合物能有效抗炎,在DSS诱导的小鼠结肠…… Continue reading
Hu-mAb工具可以对输入序列进行人源化评分,同时提示可降低免疫原性并保持疗效的人源化突变位点,以此加速人源化过程。 背景介绍 单克隆抗体(mA…… Continue reading
一个协同进化导向的蛋白-蛋白相互作用识别管道,将RoseTTAFold的速度和AlphaFold的精度结合,系统性地评估了830万对酵母蛋白之间…… Continue reading
一种整合了所有在BioPlex中亲和纯化后的人类蛋白图谱免疫荧光图像,进而创建了人类细胞结构的统一层次图谱,即MuSIC。 背景介绍 真核细胞由…… Continue reading
多核图卷积网络(GCMNK)将学习到的药物特征输入到具有三个全连接层的block中来预测DDI,AUC-ROC达到0.95,远远优于其他DDI预…… Continue reading
高通量实验与定向进化启发的深度学习方法碰撞,展示了机器学习使核靶向非生物微蛋白的从头设计将反义寡聚体输送到细胞核的过程。模型还可破译和可视化序列…… Continue reading
CS-Annotate的核心是一种多任务深度学习模型的运用,可以同时从化学位移指纹中对溶剂暴露、碱基堆积和配对状态以及单个RNA残基构象进行分类…… Continue reading