TP-DB是从PDB中提取170万个螺旋结构并编译而成的一个治疗肽设计数据库，允许查询化合物复合物模式以促进识别螺旋结构的序列基序。 背景介绍 …… Continue reading →

DD-GUI 是英属哥伦比亚大学团队联合NVIDIA开发的深度学习和对接的图形用户界面，名为“深度对接”。DD-GUI 能直观且便捷地设置大规模…… Continue reading →

背景介绍 基于片段的药物发现(FBDD)已经成为一个用来识别探针分子和先导化合物的强大工具。过去20年里，FBDD发现了4种已批准的药物，数十种…… Continue reading →

Polyply包含了：1)一种多尺度图匹配算法，用于快速生成参数，并适用于任意复杂的聚合物拓扑；2)通用的多尺度随机行走协议，能够高效地建立复杂…… Continue reading →

Hu-mAb工具可以对输入序列进行人源化评分，同时提示可降低免疫原性并保持疗效的人源化突变位点，以此加速人源化过程。 背景介绍 单克隆抗体（mA…… Continue reading →

CS-Annotate的核心是一种多任务深度学习模型的运用，可以同时从化学位移指纹中对溶剂暴露、碱基堆积和配对状态以及单个RNA残基构象进行分类…… Continue reading →

IsAb是一个专注于抗体重新设计的计算协议，主要是优化抗体序列。协议全面且免费，方便来自不同领域的用户快速上手。 背景介绍 抗体重新设计是在已知…… Continue reading →

ProteinTools不同于只含单一应用的蛋白结构分析软件，它以web服务形式提供了四种程序：疏水簇识别、氢键网络识别、盐桥识别和接触图识别。…… Continue reading →

目前，治疗耐药菌感染患者的药物种类十分有限，急需开发抗菌肽（AMPs）。本文汇总现有技术下对AMPs的结构、动力学和功能开展的研究，有利于与实验…… Continue reading →

背景介绍 AutoDock Vina (Vina)、AutoDock4 (AD4)、AutoDock-GPU、AutoDockFR以及AutoD…… Continue reading →