通过经典分子动力学和元动力学模拟，从分子间相互作用、二级结构、平均力势和自由能等方面研究了三种药物对肽细胞毒性的影响，以分析最适合治疗神经退行性…… Continue reading →

对Specs库进行虚拟筛选得到的两个靶向GyrB的抗结核杆菌抑制剂具有IC50 值分别为2.69 和 2.46 μM的生物学活性，并通过分子动力…… Continue reading →

合成一系列甲酰肽受体 2 (FPR2) 激动剂分子来优化药效和代谢稳定性，并通过对接分析了作用模式。生物学实验表明，化合物能在分子水平和细胞水平…… Continue reading →

MixMD发现了PD-1全新的可药空腔，并通过虚筛得到结合于该空腔的名为1508的新型配体，为探索靶向PD-1−PD-L1复合物的癌症治疗提供了…… Continue reading →

Polyply包含了：1)一种多尺度图匹配算法，用于快速生成参数，并适用于任意复杂的聚合物拓扑；2)通用的多尺度随机行走协议，能够高效地建立复杂…… Continue reading →

通过高通量虚拟筛选发现了MCULE-5948770040，一种作用于SARS-CoV-2主要蛋白酶的新型非共价小分子抑制剂。进一步的湿实验、X射…… Continue reading →

通过QM/MM分子动力学模拟和同位素标记实验，作者发现在倍半萜SdS合成酶中去质子化-再质子化序列可以通过G1/2 helix这段保守结构域的主…… Continue reading →

SARS-CoV-2的突变体是如何影响RBD-ACE2复合物的形成的呢？原子力显微镜和分子动力学模拟揭示了关于SARS-CoV-2突变体结合的原…… Continue reading →

通过实验结合计算的方法，证明了四环素衍生物对FP-2的变构抑制作用，预测了可能的结合模式，为进一步优化四环素骨架及发现选择性更好效力更强的抑制剂…… Continue reading →

通过分子对接、虚拟筛选、MD结合生物活性实验，中科院上药所柳红团队获得了GLP-1R的亚微摩尔级别的正变构调节剂，为设计B类GPCR的小分子药物…… Continue reading →