JCIM | 四环素衍生物可在变构位点结合并抑制疟原体半胱氨酸蛋白酶
通过实验结合计算的方法,证明了四环素衍生物对FP-2的变构抑制作用,预测了可能的结合模式,为进一步优化四环素骨架及发现选择性更好效力更强的抑制剂…… Continue reading
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通过实验结合计算的方法,证明了四环素衍生物对FP-2的变构抑制作用,预测了可能的结合模式,为进一步优化四环素骨架及发现选择性更好效力更强的抑制剂…… Continue reading
一种基于注意力的卷积神经网络深度学习模型,该模型可利用初级序列生成的简单二级结构来提供高度准确的糖基转移酶折叠预测。 背景介绍 糖基转移酶(GT…… Continue reading
使用氢-氘交换质谱(HDX-MS)结合计算建模,提供了一种新颖的方法来可视化降解诱导的三元复合物,体现了理性降解剂设计的思想,是第一个利用溶液数…… Continue reading
华中科技大学宁康教授团队基于地球上4个主要生物群落(肠道、湖泊、土壤和发酵罐)的42.5亿个微生物群落序列构建了AI模型MetaSource,预…… Continue reading
一种基于几何结构软件和深度学习的新框架DeepPoc一套挖掘苗头片段周围的化学空间的流程,它可以找到结合模式相似且新颖的类似物。在对BRD4案例…… Continue reading
一种通用且可配置的深度学习框架,可利用3D卷积神经网络进行蛋白质-蛋白质界面(PPIs)的数据挖掘。 背景介绍 高度调控的蛋白-蛋白相互作用网络…… Continue reading
中科院上药所郑明月研究员团队利用深度生成模型、激酶选择性筛选等计算手段,设计了一种新型DDR1抑制剂,该化合物能有效抗炎,在DSS诱导的小鼠结肠…… Continue reading
Hu-mAb工具可以对输入序列进行人源化评分,同时提示可降低免疫原性并保持疗效的人源化突变位点,以此加速人源化过程。 背景介绍 单克隆抗体(mA…… Continue reading
一个协同进化导向的蛋白-蛋白相互作用识别管道,将RoseTTAFold的速度和AlphaFold的精度结合,系统性地评估了830万对酵母蛋白之间…… Continue reading
一种整合了所有在BioPlex中亲和纯化后的人类蛋白图谱免疫荧光图像,进而创建了人类细胞结构的统一层次图谱,即MuSIC。 背景介绍 真核细胞由…… Continue reading