Nat. Commun. | 多肽-蛋白相互作用预测的深度学习框架
一种基于深度学习的多肽-蛋白质相互作用(PepPIs)预测框架(CAMP),包括了多肽-蛋白质相互作用预测和相应的多肽结合残基识别。 背景介绍 …… Continue reading
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RNA结合蛋白Lin28是一种重要的多能因子,可重编程翻译并促进癌症进展。本文作者结合NMR结构数据、MD和细胞实验,揭示了Lin28通过其冷休…… Continue reading
Pharmacoprin是一种高分辨率的药效团指纹,可对分子的呈现、类型和药效团特征之间的关系进行编码。 背景介绍 目前,指纹已成为编码化合物结…… Continue reading
IsAb是一个专注于抗体重新设计的计算协议,主要是优化抗体序列。协议全面且免费,方便来自不同领域的用户快速上手。 背景介绍 抗体重新设计是在已知…… Continue reading
疫情当前,mRNA疫苗成了医药界的“顶流”,而没有纳米脂质颗粒(LNP)这项革命性的递送技术,mRNA及人体基因编辑的技术路线将无法打通。基于合…… Continue reading
斯坦福大学的Rhiju Das团队提出了估算一个RNA抗水解稳定性的简单计算模型,将mRNA的平均未配对率(AUP)与其总水解率联系起来,有助于…… Continue reading
NLDock将现有的核酸-配体相互作用评分函数ITScoreNL集成到MDock程序的升级版本中,结合模式预测准确性优于Glide等且计算效率有…… Continue reading
机器学习在析氢反应 (HER) 电催化的应用处于早期。本文介绍了机器学习辅助识别基于高性能过渡金属 (TM) 的 HER 电催化剂的最新进展,重…… Continue reading
一种集成了多个深度学习和基于协同进化的接触图方法——C-QUARK,在非同源蛋白结构建模领域取得了极大进展,正确折叠的蛋白数量是其他方法的6倍。…… Continue reading
一种适用于大规模虚拟筛选的机器学习管道,可处理不断增加的类药化合物库,并区分真阳性和假阳性。 背景介绍 在过去的数十年里,虚拟筛选技术在药物发现…… Continue reading