使用氢-氘交换质谱(HDX-MS)结合计算建模，提供了一种新颖的方法来可视化降解诱导的三元复合物，体现了理性降解剂设计的思想，是第一个利用溶液数…… Continue reading →

华中科技大学宁康教授团队基于地球上4个主要生物群落(肠道、湖泊、土壤和发酵罐)的42.5亿个微生物群落序列构建了AI模型MetaSource，预…… Continue reading →

一种基于几何结构软件和深度学习的新框架DeepPoc一套挖掘苗头片段周围的化学空间的流程，它可以找到结合模式相似且新颖的类似物。在对BRD4案例…… Continue reading →

一种通用且可配置的深度学习框架，可利用3D卷积神经网络进行蛋白质-蛋白质界面(PPIs)的数据挖掘。 背景介绍 高度调控的蛋白-蛋白相互作用网络…… Continue reading →

中科院上药所郑明月研究员团队利用深度生成模型、激酶选择性筛选等计算手段，设计了一种新型DDR1抑制剂，该化合物能有效抗炎，在DSS诱导的小鼠结肠…… Continue reading →

Hu-mAb工具可以对输入序列进行人源化评分，同时提示可降低免疫原性并保持疗效的人源化突变位点，以此加速人源化过程。 背景介绍 单克隆抗体（mA…… Continue reading →

一个协同进化导向的蛋白-蛋白相互作用识别管道，将RoseTTAFold的速度和AlphaFold的精度结合，系统性地评估了830万对酵母蛋白之间…… Continue reading →

一种整合了所有在BioPlex中亲和纯化后的人类蛋白图谱免疫荧光图像，进而创建了人类细胞结构的统一层次图谱，即MuSIC。 背景介绍 真核细胞由…… Continue reading →

多核图卷积网络(GCMNK)将学习到的药物特征输入到具有三个全连接层的block中来预测DDI，AUC-ROC达到0.95，远远优于其他DDI预…… Continue reading →

通过分子对接、虚拟筛选、MD结合生物活性实验，中科院上药所柳红团队获得了GLP-1R的亚微摩尔级别的正变构调节剂，为设计B类GPCR的小分子药物…… Continue reading →