一种通用且可配置的深度学习框架，可利用3D卷积神经网络进行蛋白质-蛋白质界面(PPIs)的数据挖掘。 背景介绍 高度调控的蛋白-蛋白相互作用网络…… Continue reading →

中科院上药所郑明月研究员团队利用深度生成模型、激酶选择性筛选等计算手段，设计了一种新型DDR1抑制剂，该化合物能有效抗炎，在DSS诱导的小鼠结肠…… Continue reading →

Hu-mAb工具可以对输入序列进行人源化评分，同时提示可降低免疫原性并保持疗效的人源化突变位点，以此加速人源化过程。 背景介绍 单克隆抗体（mA…… Continue reading →

一个协同进化导向的蛋白-蛋白相互作用识别管道，将RoseTTAFold的速度和AlphaFold的精度结合，系统性地评估了830万对酵母蛋白之间…… Continue reading →

一种整合了所有在BioPlex中亲和纯化后的人类蛋白图谱免疫荧光图像，进而创建了人类细胞结构的统一层次图谱，即MuSIC。 背景介绍 真核细胞由…… Continue reading →

多核图卷积网络(GCMNK)将学习到的药物特征输入到具有三个全连接层的block中来预测DDI，AUC-ROC达到0.95，远远优于其他DDI预…… Continue reading →

通过分子对接、虚拟筛选、MD结合生物活性实验，中科院上药所柳红团队获得了GLP-1R的亚微摩尔级别的正变构调节剂，为设计B类GPCR的小分子药物…… Continue reading →

高通量实验与定向进化启发的深度学习方法碰撞，展示了机器学习使核靶向非生物微蛋白的从头设计将反义寡聚体输送到细胞核的过程。模型还可破译和可视化序列…… Continue reading →

一种可用于研究药物锂对中枢蛋白GSK-3β相互作用网络影响的新方法，同时计算了GSK-3β在锂离子或钠离子存在下与其分子伴侣的亲和力。 背景介绍…… Continue reading →