新闻动态

iANP-EC是一种集成计算框架，结合机器学习和进化计算可识别天然抗癌化合物。 背景介绍 在癌症治疗中，尽管化疗和放疗有严重的副作用，但它们仍是…… Continue reading →

两种新计算方法组成的工作流用于执行特定小分子结合任务。基于数据驱动的DEPACT可以设计和评估小分子结合的口袋能否作为独立的团簇，而PACMat…… Continue reading →

DD-GUI 是英属哥伦比亚大学团队联合NVIDIA开发的深度学习和对接的图形用户界面，名为“深度对接”。DD-GUI 能直观且便捷地设置大规模…… Continue reading →

通过关注肽和蛋白质的相互作用，首次从计算角度对肽结合位点进行的全面的形态学和能量学研究。 背景介绍 肽-蛋白相互作用与许多细胞和代谢系统的信号转…… Continue reading →

背景介绍 基于片段的药物发现(FBDD)已经成为一个用来识别探针分子和先导化合物的强大工具。过去20年里，FBDD发现了4种已批准的药物，数十种…… Continue reading →

Polyply包含了：1)一种多尺度图匹配算法，用于快速生成参数，并适用于任意复杂的聚合物拓扑；2)通用的多尺度随机行走协议，能够高效地建立复杂…… Continue reading →

通过高通量虚拟筛选发现了MCULE-5948770040，一种作用于SARS-CoV-2主要蛋白酶的新型非共价小分子抑制剂。进一步的湿实验、X射…… Continue reading →

通过QM/MM分子动力学模拟和同位素标记实验，作者发现在倍半萜SdS合成酶中去质子化-再质子化序列可以通过G1/2 helix这段保守结构域的主…… Continue reading →

SARS-CoV-2的突变体是如何影响RBD-ACE2复合物的形成的呢？原子力显微镜和分子动力学模拟揭示了关于SARS-CoV-2突变体结合的原…… Continue reading →