背景介绍 AutoDock Vina (Vina)、AutoDock4 (AD4)、AutoDock-GPU、AutoDockFR以及AutoD…… Continue reading →

引言 传统的计算方法已在化学反应领域得到广泛应用，例如，QM模拟化学键的生成和断裂，QM/MM和FMO处理涉及生物分子的反应体系等。由于可以计算…… Continue reading →

背景介绍 设计变构调节剂，需要先了解蛋白质的哪些部分可以与配体实现高亲和力结合。然而，这是一项艰巨的任务，尤其在结合位点处于“隐藏”的情况下，将…… Continue reading →

引言 癌症特异性代谢改变过度激活了哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)的激酶活性，以克服压力环境。雷帕霉素能够变构抑制mTOR复合物1(mTORC…… Continue reading →

背景介绍 随着机器学习(ML)软件(scikit-learn、TensorFlow、PyTorch等)的广泛使用以及图形处理单元成本和速度的不断…… Continue reading →

背景介绍 Molecular Transformer是当前最先进的反应预测技术，模型的输入是反应物和化学结构的文本表示，模型执行机器翻译预测最可…… Continue reading →

引言 在最近的CASP14上，DeepMind给出了非常精确的预测(即AlphaFold 2)。本文作者探索了结合相关思想的网络体系结构，并在一…… Continue reading →

引言 在这个生化环材领域人才疯狂内卷的时代，人工智能的加速发展，再一次改变着人类的生活轨迹及研究进程，至此，内卷的路越走越远，越来越卷…… 这不…… Continue reading →

背景介绍 高精度的蛋白质结构预测，有助于从分子水平上理解生物过程。在过去的几年中，由于深度卷积残差网络(ResNet)以及最近在AlphaFol…… Continue reading →