通过Rosetta和计算分析设计并验证了埃博拉病毒糖蛋白BDBV-HR2-MPER C端附近的表位是候选抗原，与纳米粒融合后在兔上测试了免疫原性…… Continue reading →

两种新计算方法组成的工作流用于执行特定小分子结合任务。基于数据驱动的DEPACT可以设计和评估小分子结合的口袋能否作为独立的团簇，而PACMat…… Continue reading →

高通量实验与定向进化启发的深度学习方法碰撞，展示了机器学习使核靶向非生物微蛋白的从头设计将反义寡聚体输送到细胞核的过程。模型还可破译和可视化序列…… Continue reading →

一种集成了多个深度学习和基于协同进化的接触图方法——C-QUARK，在非同源蛋白结构建模领域取得了极大进展，正确折叠的蛋白数量是其他方法的6倍。…… Continue reading →

背景介绍 生物大分子功能依赖于发生在不同时间尺度上的耦合过程，对这种系统的理论描述具有一定挑战性。对于蛋白质来说，折叠发生在微秒到数分钟甚至数小…… Continue reading →

引言 自然界除了作为生命基石的20种原型氨基酸外，还有多种表现出不同生理功能的非典型氨基酸(ncAAs)，它们同样可广泛用作生物活性产物的中间体…… Continue reading →

引言 大规模的构象变化对于关联蛋白质的结构和功能都至关重要，虽然分子模拟能在原子层面观察构象的转变，但许多构象是短暂形成的，分布具有随机性，确定…… Continue reading →