前沿(第八期):JCIM | 分子动力学模拟揭示BAX蛋白的激活机制
背景介绍 细胞凋亡是细胞内重要的生理过程,这一过程能够帮助维持细胞稳态和代谢平衡。BAX蛋白是Bcl-2家族的促细胞凋亡成员,它通过引起线粒体外…… Continue reading
背景介绍 细胞凋亡是细胞内重要的生理过程,这一过程能够帮助维持细胞稳态和代谢平衡。BAX蛋白是Bcl-2家族的促细胞凋亡成员,它通过引起线粒体外…… Continue reading
背景介绍 冠状病毒是RNA病毒,可感染人类和动物并引起呼吸道疾病,包括严重急性呼吸系统综合症(SARS)和中东呼吸综合症(MERS)。这些病毒严…… Continue reading
引言 自然界除了作为生命基石的20种原型氨基酸外,还有多种表现出不同生理功能的非典型氨基酸(ncAAs),它们同样可广泛用作生物活性产物的中间体…… Continue reading
引言 最近,有研究表明,某些抗癌药物与特定的小分子染料(如刚果红或IR783)共配,可以形成具有超高载药量的稳定纳米粒子。因此,研究者提出,通过…… Continue reading
引言 耐药性通过药物靶点的突变威胁到许多重要的治疗方法。人们对于突变尤其是远离活性位点的突变的组合,其改变药物结合以赋予耐药性的分子机制了解甚少…… Continue reading
引言 在药物发现过程中,准确预测小分子的疏水性是一个重要的问题。细胞和整个人体内部存在许多不同的化学环境。例如,药物必须穿过疏水性细胞膜达到其细…… Continue reading
引言 从头设计治疗分子,仍然是一个成本和时间密集的过程,新药物通常需要超过10年的时间和20-30亿美元,才能进入市场,成功率可能低至<1…… Continue reading
引言 分子动力学模拟依靠经验的势函数模型来描述分子的相互作用。利用由机器学习方法衍生的数据驱动模型,可以提高这些势函数的准确性和可转移性。本文提…… Continue reading
引言 全细胞建模与仿真,是21世纪的重大挑战之一,更是系统生物学的终极目标。利用现有的实验确定的信息,进行的详细的全细胞模型及其模拟,可用来探索…… Continue reading
引言 外排转运蛋白P-糖蛋白(P-gp)负责从细胞中转运包括药物分子在内的多种分子。因此,P-gp介导的外排转运限制了药物的生物利用度。为了在药…… Continue reading