嗅觉受体 (OR) 的氨基酸序列如何编码对各种配体的多样化反应？一个基于 OR 序列相似性和配体物理化学特征的蛋白质化学计量学 (PCM) 模型…… Continue reading →

一种肽束缚策略，可用来筛选构象确定的多肽上的非天然侧链片段。 背景介绍 合理设计的蛋白质二级和三级结构，可作为生物分子相互作用的调节剂。控制蛋白…… Continue reading →

合成一系列甲酰肽受体 2 (FPR2) 激动剂分子来优化药效和代谢稳定性，并通过对接分析了作用模式。生物学实验表明，化合物能在分子水平和细胞水平…… Continue reading →

TP-DB是从PDB中提取170万个螺旋结构并编译而成的一个治疗肽设计数据库，允许查询化合物复合物模式以促进识别螺旋结构的序列基序。 背景介绍 …… Continue reading →

数百条QM/MM轨迹证明，吸收光15fs后，反应激发态和邻近态之间的简并导致视紫红质布局分裂为亚布局。 背景介绍 视紫红质(Rhodopsin,…… Continue reading →

MixMD发现了PD-1全新的可药空腔，并通过虚筛得到结合于该空腔的名为1508的新型配体，为探索靶向PD-1−PD-L1复合物的癌症治疗提供了…… Continue reading →

iANP-EC是一种集成计算框架，结合机器学习和进化计算可识别天然抗癌化合物。 背景介绍 在癌症治疗中，尽管化疗和放疗有严重的副作用，但它们仍是…… Continue reading →

两种新计算方法组成的工作流用于执行特定小分子结合任务。基于数据驱动的DEPACT可以设计和评估小分子结合的口袋能否作为独立的团簇，而PACMat…… Continue reading →

DD-GUI 是英属哥伦比亚大学团队联合NVIDIA开发的深度学习和对接的图形用户界面，名为“深度对接”。DD-GUI 能直观且便捷地设置大规模…… Continue reading →

通过关注肽和蛋白质的相互作用，首次从计算角度对肽结合位点进行的全面的形态学和能量学研究。 背景介绍 肽-蛋白相互作用与许多细胞和代谢系统的信号转…… Continue reading →