背景介绍 自从人们认识到药物结合动力学速率可能是体内药物功效的关键决定因素，对开发计算方法的兴趣就日渐增加，以期能估计出药物-靶标解离速率常数 …… Continue reading →

背景介绍 药物发现是一项具有挑战性的任务，需要对多个参数进行优化，以适应不同的药物性质。对于靶向特定生物大分子的药物，药物与其靶点之间的充分结合…… Continue reading →

背景介绍 计算机辅助药物发现在学术界和工业界都极为重要。其中准确预测小分子与生物大分子受体的结合自由能更是重中之重。最近的研究已经证明了FEP计…… Continue reading →

背景介绍 结合自由能计算在许多研究中发挥着重要作用，但计算过程繁琐易错，让人望而却步。许多步骤需要人为干预，缺乏标准，他人难以复现。BFEE2软…… Continue reading →

引言 预测蛋白质与配体的结合亲和力以及相关的生物分子识别热力学是基于结构的药物设计的主要目标。炼金术自由能模拟为实现该目标提供了高度准确且计算效…… Continue reading →

文章简介 药物发现中的虚拟高通量筛选（vHTS）是一种识别苗头化合物的有效方法，它可以比实验性高通量筛选方法更快，更便宜。但是，主流的vHTS工…… Continue reading →

引言 当今炼金术自由能计算方法已经被广泛应用于小分子先导化合物的优化过程中，计算精度已经达到了1 kcal/mol左右。尽管如此，在已发表的研究…… Continue reading →

引言 在保证安全性和生物学功能的前提下，寻找高亲和力的配体是小分子药物开发的目标。因此，精确预测结合自由能一直是计算机辅助药物设计中的一个重要方…… Continue reading →

简介 BRIDGE（Biomolecular Reaction and Interaction Dynamics Global Environm…… Continue reading →