JCTC | 新一代AMOEBA+力场精确计算分子间能量
背景 经典的分子动力学(MD)模拟被广泛用于研究化学和生物系统的物理性质。MD模拟中的基本要素之一是力场(FFs)的精度,其中包括描述分子内和分…… Continue reading
背景 经典的分子动力学(MD)模拟被广泛用于研究化学和生物系统的物理性质。MD模拟中的基本要素之一是力场(FFs)的精度,其中包括描述分子内和分…… Continue reading
静电势表面 众所周知,分子的静电性质可以用于预测分子的化学反应性及分子间相互作用力。一般来说,分子ESP表面是通过在分子表面上移动单位电荷探针生…… Continue reading
背景 打分函数广泛应用于基于结构的计算辅助药物设计,其通过定量化评估药-靶的相互作用为药物研发中的药效评估提供理论依据[1-5],提高活性化合物…… Continue reading
神经网络因其强大的近似拟合能力,被广泛应用在各种各样的领域。现在,量子化学也在逐渐使用神经网络进行相关的工作了。近日,DeepMind 的科学家…… Continue reading
手性多取代四氢吡咯骨架广泛存在于有机催化分子,生物和药物活性分子中。目前,构建多取代四氢吡咯骨架最直接简便的方法是,甲亚胺叶立德与烯烃的1,3-…… Continue reading
化学合成中开发新的催化剂方法 蛋白酶活性位点通过限制特定位点的肽键来保持对底物的高度特异选择性。催化剂设计中的主要挑战是将其从效果不佳的原型结构…… Continue reading
蛋白质结合口袋(protein binding pockets,以下简称口袋)是指蛋白质表面或内部具有适合与配体结合的空腔,口袋周围的氨基酸残基…… Continue reading
背景 神经退行性疾病是错误折叠的蛋白质在神经元中的缓慢积累的结果。这些疾病所涉及的蛋白质可能有所不同,但结果却是相似的。神经元因错误折叠的蛋白质…… Continue reading
先睹为快 靶点 二酰基甘油脂肪酶diacylglycerol lipase (DAGL) 小分子配体 三氮唑杂环抑制剂DH376及5个类似物 计…… Continue reading
先睹为快 靶点 A3腺苷受体adenosine A3receptor (A3R) 小分子配体 激动剂分子NECA和IB-MECA 计算方法 同源…… Continue reading