唯信工坊 | 计算（AI）辅助药物设计系列课程

ChatGPT火到出圈， AI技术又双叒叕一次引爆全民热议，各行各业竞相探索新一代AI技术带来的无限潜力。每个人都迫切希望掌握AI技能，以提高竞争实力，在未来的发展中抢占先机。

药物研发领域首当其冲，作为药学精英的你，是否已经心动已久了呢？AIDD、CADD、AlphaFold、Rosetta、Schrodinger、RDKit、Biopython、Pytorch、…… 你对这些名词一定早已耳闻，但对于生物医药领域的初学者，或者长期从事实验研究的你，能熟练灵活使用这些技术和工具软件并不是一件容易的事，复杂的软件操控界面，纷乱的命令格式、功能函数、设置参数，足以让人心生畏惧、望而却步。

网上免费课程多如牛毛，各种药物设计培训广告铺天盖地，这些真能快速解决你眼前的问题吗？你身边的同学和同事，花了数天的时间跟班上课，遇到现实问题仍然是一头雾水，效果往往差强人意。

有鉴于此，唯信团队推出“唯信工坊”系列AIDD/CADD药物设计课程，基于WeMol新一代AI药物设计与计算平台，引导药物研发人员轻松入门，快速掌握主流药物设计技术，真正掌握解决具体问题的能力。

唯信是国内最早从事药物设计技术服务的老牌专业团队之一，过去8年中，为国内外医药领域500+企事业单位提供过数千个各类项目的计算服务。基于大量计算服务实践，本课程归纳和整理了一线科研人员的最常见需求，精心设计大分子生物药设计、小分子化学药设计、分子模拟等主题培训内容。让你即学即用，一步跨入人工智能时代。

 AI计算，触手可及

《唯信工坊》即日开放报名，首批课程面向抗体等大分子生物药设计：

讲师介绍

曾在恒瑞医药、先声药业等大型制药企业担任计算生物学负责人，作为核心成员参与过数十个临床前新药研发项目，十余个项目已经进入临床研究阶段，作为主要设计者研发的一款大分子药物成功达成了数亿美金海外授权。在NPR、JCIM等学术期刊发表SCI论文数十篇，被引500余次，并担任多个期刊的审稿人。主持国家自然科学青年基金，参与国家新药创制重大专项、科技部863计划、自然科学基金重点和面上项目，申请新药发明专利数十项（包括多项国际专利）和多项软件著作权。

课程大纲

1.1. 蛋白晶体数据库和结构检索

1.2. 结构预测方法概述

1.3. 蛋白质结构通用预测方法

1.4. 抗体结构预测和优化

1.5. 基于AI的蛋白结构预测

1.6. 【经验心得】实验信息辅助的结构预测

2.1. 抗体可变区编号规则及异同

2.2. 对抗体可变区进行编号并识别CDR与FR

2.3. 使用EU规则对抗体恒定区进行编号

2.4. TCR的可变区编号

3.1. 快速序列编辑与可视化标注

3.2. 多序列比对

3.3. 同源性计算

3.4. 氨基酸频率分析与序列logo绘制

3.5. 进化分析与进化树绘制

3.6. 多序列聚类分析及可视化

3.7. 【经验心得】基于抗体CDR（忽略FR）进行序列分析

3.8. 【案例讲解】快速制作、导出美观的序列比对与分析图表

4.1. 抗体人源化设计的原理与进展

4.2. 【案例讲解】五分钟完成抗体人源化设计

4.3. 【经验心得】优化人源化设计：模板与回复突变的选择

4.4. 【经验心得】纳米抗体人源化设计的异同

5.1. 蛋白的虚拟亲和力成熟

5.2. 抗体的虚拟亲和力成熟

6.1. 免疫原性预测的原理与进展

6.2. 【案例讲解】一分钟完成免疫原性预测

6.3. 【经验心得】免疫原性预测结果分析与早期发现项目中的决策考量

6.4. 【经验心得】去免疫原性改造策略与突变设计

6.5. 快速批量生成突变序列

7.1. 常见PTM风险位点预测

7.2. 【经验心得】PTM位点突变策略

7.3. 理化性质预测（溶解度、等电点（pI）、聚集倾向等）

7.4. 蛋白质表面分析

7.5. 【案例讲解】设计突变提升蛋白热稳定性、表达量、纯度

8.1. 氨基酸编码转换

8.2. 【案例讲解】快速批量提取分析专利序列

8.3. 检索专利保护的蛋白质序列

8.4. 基于抗体CDR的专利检索

9.1. 基于已知序列进行优化设计

9.2. 特定区域的序列预测与生成

9.3. 从头蛋白质设计

10.1. DNA序列翻译

10.2. 密码子优化

10.3. mRNA序列优化

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